Дальнейшее пребывание

Я жила 3 месяца в РФ по имигационной карте, затем из-за болезни я не смогла выехать, регистрацию сделать не получается, как узанить мое пребывание на территории РФ?

вам нужно выехать в любом случае. Сейчас вы нелегал, чем дольше будете здесь, тем жестче потом будут меры, вплоть до выдворения. Сейчс отделаетесь штрафом. Узаконить вы сейчас ничего не можете - упущено время, миграционна карта просрочена и с вами скейчас будут общаться как с нелегалом.