что делать

Здравствуйте.Я гражданин России с 1991 года в этом году женился на гражданке Азербайджана.Прописан в Московской области в закрытом военном городке (бывший офицер СССР)В моей квартире кроме меня прописаны мои бывшая жена и дети.(раведены с 1994г)Без ихнего согласия я там не могу никого зарегистрировать.Жену приходится регистрировать в квартиру её отца в Москве на три месяца(он собственник но не гражданин России)Теперь каждые три месяца ей приходиться ездить в Баку что бы она могла здесь (Москва) зарегистрироваться.Подскажите может есть какой нибудь выход?

Она может получить разрешение на временное проживание - дает право проживать 3 года, а потом вид на жительство - на 5 лет.